菲律宾新冠病毒呈现5种谱系本地传播多为来自欧美等国
发布日期:2021-06-07 04:03 点击次数:111
当地时间8月19日,热带医学研究所(RITM)表示,目前在该国传播的新冠肺炎病毒拥有来自不同国家的“谱系”。
在一份声明中热带医学研究所表示,菲律宾的新冠肺炎疫情源自于多种病毒株,其中部分可以追溯到中国、亚太其他国家以及欧洲和北美部分地区的病毒。
该机构补充说:“到目前为止,热带医学研究所和菲律宾基因组中心(PGC)已经对多位患者的新冠病毒基因组进行了测序,但这仅代表该国新冠病毒(SARS-CoV-2)传播的一小幅图景。然而,测序结果表明,从2020年1月至2020年7月,该国多次引入不同的新冠病毒谱系和毒株。”
早在7月,菲律宾基因组中心就向媒体透露称,菲律宾已检测到新冠病毒的主要变异体,但科学家表示,在得出任何实质性结论之前该机构还需要做更多的研究。
根据热带医学研究所的数据,菲律宾共有17个全基因组序列与全球共享流感数据倡议(GISAID)共享,这是一个开放获取的数据库,可快速共享测序数据,为全球应对流行病和传染疾病做出贡献。
基于这些序列,从1月、3月和6月共鉴定出5个谱系,分别是A,B,B.1,B.1.1和B.6。
热带医学研究所表示:“A和B系是来自中国的原始病毒株,B.1和B.1.1系系与意大利和其他欧洲国家的新冠肺炎疫情有关。与此同时,在印度、英国、北美、澳大利亚和新加坡也发现了B.6系的病毒株。”
专家表示,在菲律宾发现的首三例新冠患者(全部为中国游客)的病毒株都属于A和B系列,这两个都是源自于中国的原始病毒株。
与此同时,国都区和内湖省(Laguna)等附近省份没有旅行史,却仍感染新冠病毒的患者的病毒株与在欧洲传播的病毒株相似。
热带医学研究所表示:“在3月份采集的样本中,几乎所有的序列都属于B.6系列。只有两个病例来自日本和韩国,而其他病例在采集样本时没有近期出国旅行的记录。”
该机构解释说,在最近检测的菲律宾样本中,有一个属于谱系B.1.1的样本,具有所谓的显性D614G突变,这种突变与传输效率的提高有关。6月和7月在国都区和内湖省采集的另外7个样本中也检测到了这种突变。
该研究所表示,这就是为什么菲律宾需要对更多的新冠病毒样本进行基因测序,以“更清晰地了解病毒如何在当地社区传播,并帮助卫生当局更好地了解哪些缓解和控制措施是必要的。”
它说:“以前的流行病数据表明,病原体基因组中的突变可能会产生新的病毒株,从而导致更严重的疾病或在人与人之间更容易传播。通过限制新毒株进入该国,我们不仅可以帮助减少感染的传播,还可以防止新的潜在的、毒性更强和/或传染性更强的毒株进入该国。”
菲卫生部表示,热带医学研究所正在进行的基因测序是由该机构资助,并且是与英国格拉斯哥大学合作进行的。
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